الفطريات ليست نباتات ولا حيوانات ولكنها تلعب دوراً بالغ الأهمية في النظام البيئي للغابات. يمكن العثور على حوالي 6000 نوع مختلف في ألمانيا، منها 500 إلى 700 نوع في منطقة كوتنفورست. عندما تنبت قبعات الفطر من الأرض أو على الأشجار، لا يظهر سوى جزء صغير من الفطر، وهو الجسم المثمر. أما الجزء الأكبر، أو ما يسمى بالفطريات، فهو عبارة عن شبكة كثيفة تحت السطح.

وتشكل العديد من الأنواع الفطرية شراكات وثيقة مع أشجار الغابات، أو ما يسمى بالتكافل الذي يعود بالنفع على الجانبين. تنمو شبكة الفطريات حول أطراف جذر الشجرة وتمدها بالمواد المغذية وتحميها من مسببات الأمراض. وفي المقابل، تحصل في المقابل على الكربوهيدرات التي تنتجها الشجرة أثناء عملية التمثيل الضوئي. ولولا الفطريات الجذرية لنمت الأشجار بشكل أسوأ بكثير. ويسمى هذا التكافل بين الفطريات والأشجار بالفطريات الفطرية.

تعيش الفطريات الأخرى كطفيليات، خاصة على الأشجار الميتة والميتة. تخترق الطفيليات، مثل فطريات العسل، الشجرة الحية من خلال الجروح الموجودة ويمكن أن تتسبب في موتها. وبدون الفطريات، ستنهار دورة المغذيات في الغابة بالفعل. لأنه - على النقيض من الكثير من الكائنات الحية الأخرى - يمكن للعديد من أنواع الفطريات أن تحلل الخشب.

كما أن الفطريات مصدر مهم لغذاء القواقع والديدان وخنافس الروث والفئران والعديد من الأنواع الحيوانية الأخرى.